फिर भी उस पद पर मनमोहन सिंह ने थॉमस को तब तक नियुक्त रखा जब तक सुप्रीम कोर्ट ने थॉमस की नियुक्ति को खारिज करने का आदेश नहीं दिया।
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बचाव पक्ष द्वारा की गई प्रतिपरीक्षा में इसने यह कहा कि किसी को आवंटित भूखण्ड स्वतः ही निरस्त नहीं हो जाता है और उसके लिये खारिज करने का आदेश पारित करना आवश्यक है।
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कोर्ट ने शुरू में कहा कि जनप्रतिनिधित्व कानून में संशोधन के मद्देनजर केंद्र सरकार की पुनर्विचार याचिका निरर्थक हो गई है लेकिन बाद में एनजीओ के जोर देने पर इसे खारिज करने का आदेश दिया गया।
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धारा 203 द0 प्र0 सं0 के अंतर्गत परिवाद खारिज होने की दशा में निगरानी न्यायालय तभी हस्तक्षेप कर सकती है, जहॉः-(क) (ख) (ग) परिवाद खारिज करने का आदेश बिना कारण दर्शित किये पारित किया गया हो।
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न्यायालय ने शुरू में कहा कि जनप्रतिनिधित्व कानून में संशोधन के मद्देनजर केन्द्र सरकार की पुनर्विचार याचिका निरर्थक हो गई है लेकिन बाद में गैर सरकारी संगठन के जोर देने पर इसे खारिज करने का आदेश दिया गया।
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परिवाद खारिज करने का आदेश असंगत एवं अवैधानिक आधारों पर पारित किया गया हो एवं जहॉ विद्वान मजिस्टेट ने परिवाद में अंकित तथ्यों एवं उपलब्ध सबूतों से अन्यथा तथ्यों पर अनुचित ढंग से विश्वास करके प्रश्नगत आदेश पारित किया हो।
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उत्तर प्रदेश के भदोही में मुख्य न्यायिक दंडाधिकारी की अदालत ने एक वर्ष पूर्व हुई मारपीट के आरोप में संत आसाराम बापू और उनके चेलों को पुलिस की ओर से क्लीनचिट दिए जाने वाली रिपोर्ट को खारिज करने का आदेश दिया है।
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निर्वाचन अधिकारी वीके अग्निहोत्री को लिखे पत्र में संगमा ने मांग की है कि आदेश की कापी बुधवार को शाम पांच बजे तक उन्हें सौंपी जाए क्योंकि आपत्तियों को खारिज करने का आदेश दिए जाने के बाद 24 घंटे से ज्यादा गुजर गए हैं।
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रमैया ने अपने एक विवादास्पद फ़ैसले में गया के एतिहासिक भुसुंडा मेला की अरबो रुपये की जमीन को एक भू-माफ़िया धिरेन्द्र कुमार के पक्ष में, जो जदयू का नेता है दाखिल खारिज करने का आदेश प्रदान कर के करोड रुपया कमा लिया।